雞舍與其他畜舍不同，舍內飼養設備下的糞槽因飼養方式和清糞方式的不同而異。常用的雞舍清糞方式有兩類：一類是經常性清糞，即每天定時清糞1-2次，所用設備有刮板式清糞機、傳送帶式清糞機和抽屜式清糞板；另一類是一次性清糞，即飼養一定時期(如數天、數月甚至一個飼養周期)清一次糞，由于時間間隔較長，要求雞舍配備較強的通風設備，以控制雞舍內有害氣體的濃度不超標。常用的設備是拖拉機前懸掛式清糞鏟，這類設備一般適用于高床籠養雞舍或散養雞舍。

1．階梯式籠養和網上平養

雞舍下面的糞槽與籠具和網床方向相同，通長設計，寬度略小。糞槽底部低于舍內地面10-30cm，用人工和機械清糞均可。

(1)人工清糞雞舍每排支架下方皆有很淺的糞坑，為便于清糞，糞坑向外以弧度與舍內地坪相連，人工用刮板從支架下方將糞刮出，然后鏟到糞車上，推送至糞場。

(2)機械清糞時，可用刮板式清糞機。全行程式刮板清糞機適用于短糞溝；步進式刮板清糞機適用于長距離刮糞。為保證刮糞機正常運行，要求糞溝平直，溝底表面越平滑越好，因此對土建要求嚴格。可根據不同雞舍形式組裝成單列式、雙列式和三列式。

2．疊層式籠養

雞舍雞糞由籠間的承糞帶承接，并由傳送帶將雞糞送到雞籠的一端，由刮糞板將雞糞刮下，落入橫向的糞溝由螺旋彈簧清糞機搬出雞舍。

3．育雛雞舍

不必設置糞坑。

4．高床、半高床雞舍

下面糞坑的面積與雞舍相同，高床籠養雞舍糞坑高度在1.5-1.8m。半高床籠養雞舍糞坑高度在1.0-1.3m。清糞在飼養結束后一次進行。